Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
9230113P08RikD3YWX3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
9230113P08RikD3YWX3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
9230113P08RikD3YWX3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
9230113P08RikD3YWX3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.7 ms