Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rexo5D3YW29 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rexo5D3YW29 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rexo5D3YW29 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rexo5D3YW29 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rexo5D3YW29 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rexo5D3YW29 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rexo5D3YW29 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rexo5D3YW29 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rexo5D3YW29 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rexo5D3YW29 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rexo5D3YW29 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rexo5D3YW29 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rexo5D3YW29 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rexo5D3YW29 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rexo5D3YW29 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rexo5D3YW29 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rexo5D3YW29 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Rexo5D3YW29 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rexo5D3YW29 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rexo5D3YW29 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rexo5D3YW29 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms