Protein–RNA interactions for Protein: B8JK39

Itga9, Integrin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga9B8JK39 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga9B8JK39 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga9B8JK39 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga9B8JK39 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms