Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hbb-bh2B2RVB7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hbb-bh2B2RVB7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hbb-bh2B2RVB7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms