Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN2

Igsf23, Immunoglobulin superfamily, member 23, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf23B2RTN2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf23B2RTN2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf23B2RTN2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Igsf23B2RTN2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms