Protein–RNA interactions for Protein: B2RT44

Lonrf2, LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf2B2RT44 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lonrf2B2RT44 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lonrf2B2RT44 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lonrf2B2RT44 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf2B2RT44 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf2B2RT44 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf2B2RT44 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf2B2RT44 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf2B2RT44 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf2B2RT44 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf2B2RT44 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf2B2RT44 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf2B2RT44 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf2B2RT44 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms