Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trabd2bB1ATG9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trabd2bB1ATG9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trabd2bB1ATG9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms