Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pramef20B1ARV6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef20B1ARV6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef20B1ARV6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef20B1ARV6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef20B1ARV6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef20B1ARV6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef20B1ARV6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef20B1ARV6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef20B1ARV6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef20B1ARV6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef20B1ARV6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef20B1ARV6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef20B1ARV6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef20B1ARV6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms