Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp8b5A3FIN4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp8b5A3FIN4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp8b5A3FIN4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp8b5A3FIN4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp8b5A3FIN4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp8b5A3FIN4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp8b5A3FIN4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp8b5A3FIN4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp8b5A3FIN4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp8b5A3FIN4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp8b5A3FIN4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp8b5A3FIN4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp8b5A3FIN4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp8b5A3FIN4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp8b5A3FIN4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp8b5A3FIN4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp8b5A3FIN4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp8b5A3FIN4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp8b5A3FIN4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp8b5A3FIN4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp8b5A3FIN4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp8b5A3FIN4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp8b5A3FIN4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp8b5A3FIN4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp8b5A3FIN4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp8b5A3FIN4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp8b5A3FIN4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp8b5A3FIN4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp8b5A3FIN4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp8b5A3FIN4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8b5A3FIN4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8b5A3FIN4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8b5A3FIN4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8b5A3FIN4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp8b5A3FIN4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp8b5A3FIN4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp8b5A3FIN4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp8b5A3FIN4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp8b5A3FIN4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp8b5A3FIN4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp8b5A3FIN4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp8b5A3FIN4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp8b5A3FIN4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp8b5A3FIN4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp8b5A3FIN4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms