Protein–RNA interactions for Protein: A2BI93

Ssxb9, Synovial sarcoma, X member B9, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb9A2BI93 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssxb9A2BI93 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ssxb9A2BI93 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssxb9A2BI93 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ssxb9A2BI93 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssxb9A2BI93 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssxb9A2BI93 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssxb9A2BI93 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssxb9A2BI93 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssxb9A2BI93 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssxb9A2BI93 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssxb9A2BI93 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssxb9A2BI93 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssxb9A2BI93 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssxb9A2BI93 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssxb9A2BI93 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssxb9A2BI93 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms