Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ism1A2ATD1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ism1A2ATD1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ism1A2ATD1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ism1A2ATD1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ism1A2ATD1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ism1A2ATD1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ism1A2ATD1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ism1A2ATD1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ism1A2ATD1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ism1A2ATD1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ism1A2ATD1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ism1A2ATD1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ism1A2ATD1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ism1A2ATD1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ism1A2ATD1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms