Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SetxA2AKX3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SetxA2AKX3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SetxA2AKX3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SetxA2AKX3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SetxA2AKX3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms