Protein–RNA interactions for Protein: A2AAY5

Sh3pxd2b, SH3 and PX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2bA2AAY5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3pxd2bA2AAY5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3pxd2bA2AAY5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3pxd2bA2AAY5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh3pxd2bA2AAY5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh3pxd2bA2AAY5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3pxd2bA2AAY5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3pxd2bA2AAY5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3pxd2bA2AAY5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3pxd2bA2AAY5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3pxd2bA2AAY5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3pxd2bA2AAY5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3pxd2bA2AAY5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms