Protein–RNA interactions for Protein: A2A7F4

Rlf, MCG122876, mousemouse

Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlfA2A7F4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RlfA2A7F4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RlfA2A7F4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms