Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Prdm2A2A7B5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Prdm2A2A7B5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Prdm2A2A7B5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Prdm2A2A7B5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Prdm2A2A7B5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Prdm2A2A7B5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Prdm2A2A7B5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Prdm2A2A7B5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Prdm2A2A7B5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Prdm2A2A7B5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Prdm2A2A7B5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Prdm2A2A7B5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Prdm2A2A7B5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Prdm2A2A7B5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Prdm2A2A7B5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Prdm2A2A7B5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Prdm2A2A7B5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Prdm2A2A7B5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Prdm2A2A7B5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Prdm2A2A7B5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Prdm2A2A7B5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Prdm2A2A7B5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Prdm2A2A7B5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Prdm2A2A7B5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Prdm2A2A7B5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Prdm2A2A7B5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Prdm2A2A7B5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Prdm2A2A7B5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Prdm2A2A7B5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Prdm2A2A7B5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Prdm2A2A7B5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Prdm2A2A7B5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Prdm2A2A7B5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Prdm2A2A7B5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Prdm2A2A7B5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Prdm2A2A7B5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.81
Prdm2A2A7B5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Prdm2A2A7B5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Prdm2A2A7B5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Prdm2A2A7B5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Prdm2A2A7B5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Prdm2A2A7B5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Prdm2A2A7B5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Prdm2A2A7B5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Prdm2A2A7B5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Prdm2A2A7B5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Prdm2A2A7B5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Prdm2A2A7B5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Prdm2A2A7B5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Prdm2A2A7B5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
Prdm2A2A7B5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
Prdm2A2A7B5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Prdm2A2A7B5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Prdm2A2A7B5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Prdm2A2A7B5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Prdm2A2A7B5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Prdm2A2A7B5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Prdm2A2A7B5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Prdm2A2A7B5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Prdm2A2A7B5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Prdm2A2A7B5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Prdm2A2A7B5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Prdm2A2A7B5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Prdm2A2A7B5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Prdm2A2A7B5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Prdm2A2A7B5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Prdm2A2A7B5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Prdm2A2A7B5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Prdm2A2A7B5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Prdm2A2A7B5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Prdm2A2A7B5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Prdm2A2A7B5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Prdm2A2A7B5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Prdm2A2A7B5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Prdm2A2A7B5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Prdm2A2A7B5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Prdm2A2A7B5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Prdm2A2A7B5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Prdm2A2A7B5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms