Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Calcoco2A2A6M5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Calcoco2A2A6M5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calcoco2A2A6M5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187 ms