Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2l1A2A259 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2l1A2A259 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2l1A2A259 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms