Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc173A0JLY1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc173A0JLY1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc173A0JLY1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc173A0JLY1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc173A0JLY1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc173A0JLY1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc173A0JLY1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc173A0JLY1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc173A0JLY1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc173A0JLY1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc173A0JLY1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc173A0JLY1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms