Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVP8

Gm5580, Predicted pseudogene 5580, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5580A0A0N4SVP8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5580A0A0N4SVP8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm5580A0A0N4SVP8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm5580A0A0N4SVP8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm5580A0A0N4SVP8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5580A0A0N4SVP8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5580A0A0N4SVP8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5580A0A0N4SVP8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5580A0A0N4SVP8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5580A0A0N4SVP8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5580A0A0N4SVP8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5580A0A0N4SVP8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5580A0A0N4SVP8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5580A0A0N4SVP8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5580A0A0N4SVP8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5580A0A0N4SVP8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5580A0A0N4SVP8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5580A0A0N4SVP8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5580A0A0N4SVP8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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