Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPA5

Gm28961, Predicted gene 28961, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28961A0A087WPA5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20,03■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,03■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,03■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,02■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,01■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20,01■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,98■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,96■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,96■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19,96■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Gm28961A0A087WPA5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19,95■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,95■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19,94■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19,94■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19,93■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,93■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,92■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19,92■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19,91■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,9■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,9■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Gm28961A0A087WPA5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,89■□□□□ 0,77
Gm28961A0A087WPA5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Gm28961A0A087WPA5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Gm28961A0A087WPA5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Gm28961A0A087WPA5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Gm28961A0A087WPA5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Gm28961A0A087WPA5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Gm28961A0A087WPA5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Gm28961A0A087WPA5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Gm28961A0A087WPA5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,88■□□□□ 0,77
Gm28961A0A087WPA5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Gm28961A0A087WPA5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Gm28961A0A087WPA5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Gm28961A0A087WPA5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19,87■□□□□ 0,77
Gm28961A0A087WPA5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19,87■□□□□ 0,77
Gm28961A0A087WPA5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Gm28961A0A087WPA5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Gm28961A0A087WPA5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,9 ms