Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTNAP2Q9UHC6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms