Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms