Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Snx29Q9D3S3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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Snx29Q9D3S3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Snx29Q9D3S3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Snx29Q9D3S3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Snx29Q9D3S3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Snx29Q9D3S3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Snx29Q9D3S3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Snx29Q9D3S3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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