Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC123767.1-204ENST00000523523 273 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011447.3-205ENST00000592022 1268 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms