Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms