Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms