Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms