Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms