Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmod2Q3UHZ5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms