Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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