Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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KCNC3Q14003 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNC3Q14003 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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