Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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