Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms