Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms