Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms