Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPC1P35052 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPC1P35052 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPC1P35052 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPC1P35052 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms