Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms