Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms