Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms