Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX3Q9UBR4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX3Q9UBR4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX3Q9UBR4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX3Q9UBR4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX3Q9UBR4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX3Q9UBR4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX3Q9UBR4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX3Q9UBR4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX3Q9UBR4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX3Q9UBR4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX3Q9UBR4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX3Q9UBR4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX3Q9UBR4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX3Q9UBR4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms