Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms