Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms