Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms