Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms