Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q71RC1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q71RC1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms