Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms