Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
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