Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AC027020.1-201ENST00000559349 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AC003991.1-203ENST00000591739 719 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AP000866.2-201ENST00000504932 1493 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 TAS2R1-201ENST00000382492 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AL645634.1-201ENST00000418426 462 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AL731577.1-201ENST00000449984 830 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AP000962.2-201ENST00000624971 1101 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 KLF3-AS1-205ENST00000507091 642 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 WDYHV1-201ENST00000287387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AP001010.1-201ENST00000588397 538 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AC090373.1-201ENST00000623955 603 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms