Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRIM1P49642 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms