Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5CP41229 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KDM5CP41229 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5CP41229 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5CP41229 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KDM5CP41229 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5CP41229 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5CP41229 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KDM5CP41229 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5CP41229 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms